Dewasa ini banyak sekali teknik penanaman yang dikembangkan guna mengantisipasi menipisnya lahan pertanian yang disebabkan oleh pembangunan yang masif. Salah satu metode penanam yang dikembangkan di era modern ini adalah menanam dengan teknik hidroponik. Pesantren Khatamun Nabiyyin terpilih oleh Dinas ketahanan pangan, Kelautan dan Pertanian (Dinas KPKP) DKI Jakarta untuk Program Urban Farming. Khatamun Nabiyyin mendapatkan dua set hidroponik dan paket benih serta media tanam produk Hydro Farm dari Dinas KPKP DKI Jakarta.
Santri dan Mahasantri juga turut terlibat dalam merawat tanaman hidroponik ini. Di tengah-tengah kepadatan program belajarnya, para santri dan Mahasantri berupaya menyempatkan dan meluangkan waktunya untuk ikut serta dalam pengembangan urban farming. Dengan upaya kecil ini para santri telah ikut andil dalam menjaga ketahanan pangan Indonesia. Diharapkan dengan hadirnya Hydro Farm ini kebutuhan pangan Indonesia menjadi swasembada.
